rpy2¶
初次体验 rpy2
安装¶
尝试过两种安装方法
1¶
conda install rpy2: 除了装 rpy2，也会装 r-base 及一些 R 中的核心包，即便系统中已经有 R 了。具体如下
Downloading and Extracting Packages
pango-1.42.4 | 528 KB | ##################################### | 100%
curl-7.65.3 | 141 KB | ##################################### | 100%
r-bit-1.1_14 | 243 KB | ##################################### | 100%
r-plogr-0.2.0 | 20 KB | ##################################### | 100%
certifi-2019.9.11 | 154 KB | ##################################### | 100%
gfortran_linux-64-7. | 10 KB | ##################################### | 100%
r-dbi-1.0.0 | 916 KB | ##################################### | 100%
r-r6-2.4.0 | 68 KB | ##################################### | 100%
ca-certificates-2019 | 131 KB | ##################################### | 100%
fribidi-1.0.5 | 112 KB | ##################################### | 100%
libssh2-1.8.2 | 250 KB | ##################################### | 100%
r-assertthat-0.2.1 | 74 KB | ##################################### | 100%
r-bh-1.69.0_1 | 10.9 MB | ##################################### | 100%
r-rlang-0.3.4 | 1.0 MB | ##################################### | 100%
r-crayon-1.3.4 | 757 KB | ##################################### | 100%
make-4.2.1 | 429 KB | ##################################### | 100%
r-pillar-1.3.1 | 180 KB | ##################################### | 100%
krb5-1.16.1 | 1.4 MB | ##################################### | 100%
r-dbplyr-1.4.0 | 622 KB | ##################################### | 100%
libcurl-7.65.3 | 588 KB | ##################################### | 100%
r-rsqlite-2.1.1 | 1010 KB | ##################################### | 100%
r-cli-1.1.0 | 189 KB | ##################################### | 100%
tktable-2.10 | 88 KB | ##################################### | 100%
_r-mutex-1.0.0 | 2 KB | ##################################### | 100%
r-tidyselect-0.2.5 | 138 KB | ##################################### | 100%
r-utf8-1.1.4 | 159 KB | ##################################### | 100%
r-pkgconfig-2.0.2 | 25 KB | ##################################### | 100%
r-prettyunits-1.0.2 | 38 KB | ##################################### | 100%
r-bit64-0.9_7 | 487 KB | ##################################### | 100%
bwidget-1.9.11 | 113 KB | ##################################### | 100%
r-rcpp-1.0.1 | 3.3 MB | ##################################### | 100%
r-fansi-0.4.0 | 193 KB | ##################################### | 100%
r-blob-1.1.1 | 40 KB | ##################################### | 100%
r-digest-0.6.18 | 155 KB | ##################################### | 100%
r-memoise-1.1.0 | 45 KB | ##################################### | 100%
r-dplyr-0.8.0.1 | 1.9 MB | ##################################### | 100%
gfortran_impl_linux- | 9.0 MB | ##################################### | 100%
r-purrr-0.3.2 | 397 KB | ##################################### | 100%
r-glue-1.3.1 | 165 KB | ##################################### | 100%
r-magrittr-1.5 | 173 KB | ##################################### | 100%
rpy2-2.9.4 | 272 KB | ##################################### | 100%
r-base-3.6.0 | 39.4 MB | ##################################### | 100%
r-tibble-2.1.1 | 316 KB | ##################################### | 100%
2¶
pip install rpy2: 则只会装 rpy2，如果没有权限，可以再加上 --user 选项。
Successfully installed MarkupSafe-1.1.1 atomicwrites-1.3.0 attrs-19.3.0 cffi-1.13.2 importlib-metadata-0.23 jinja2-2.10.3 more-itertools-7.2.0 packaging-19.2 pluggy-0.13.0 py-1.8.0 pycparser-2.19 pytest-5.2.2 rpy2-3.2.2 simplegeneric-0.8.1 tzlocal-2.0.0 wcwidth-0.1.7 zipp-0.6.0
但是使用时，没找到 libR.so，猜测可能是因为编译时没有指定 --enable-R-shlib，详见 Compiling R 3.5.1 from source, no libR.so 或者 Building R from source。